شورای پژوهشی متشکل از معاون پژوهشی، دبیر فرهنگستان و نمایندگان گروه های علمی فرهنگستان است. جلسات این شورا دو هفته یک بار تشکیل می شود. ریاست شورا با معاون پژوهشی است.
اعضای شورا (به ترتیب حروف الفبا)
- دکتر حسن احمدی (نماینده گروه علوم کشاورزی)
- دکتر غلامرضا اعوانی (نماینده گروه علوم اسلامی)
- دکتر محمدمهدی شیخ جباری (نماینده گروه علوم پایه)
- دکتر علی اکبر صالحی (معاون پژوهشی)
- دکتر حسن ظهور (نماینده گروه علوم مهندسی)
- دکتر رضا فرجی دانا (دبیر فرهنگستان)
- دکتر محمدرضا مخبر دزفولی (نماینده گروه علوم دامپزشکی)
- دکتر فرشاد مؤمنی (نماینده گروه علوم انسانی)
وظايف شورای پژوهشی
- مطالعه سیاست های کلان پژوهشی کشور و فرهنگستان، تدوین سیاست های پژوهشی فرهنگستان با توجه به اهداف و وظایف فرهنگستان و در راستای چشم انداز و اعلام آن به رئيس فرهنگستان
- بررسی و تعیین راه های ارتباط پژوهشی فرهنگستان با مسئولان پژوهشی سازمان ها و مؤسسات پژوهشی داخل و خارج کشور
- بررسی فعالیت های پژوهشی گروه های علمی فرهنگستان و ارائه پیشنهادهای لازم جهت ارتقای وضع پژوهشی آنها
- تدوین آیین نامه های داخلی مرتبط با طرح ها و فعالیت های پژوهشی و نظایر آنها و ارائه به رئیس فرهنگستان
- بررسی مسائل و مشکلات پژوهشی فرهنگستان
- تهیه برنامه های کوتاه مدت، میان مدت و بلند مدت فعاليت های پژوهشی فرهنگستان و اعلام آن به رئیس فرهنگستان
- بررسی موضوعات مرتبط با امور پژوهشی فرهنگستان ارائه شده از سوی گروه های علمی و اعلام نظر به رئیس فرهنگستان
- بررسی و اعلام نظر در خصوص پیشنهاد طرح های پژوهشی جدید و اعلام به شورای علمی جهت تصویب نهایی آن
- تعیین داور یا ناظر برای ارزیابی گزارش های مرحله ای و نهایی طرح های پژوهشی
- اظهار نظر در مورد نتایج حاصل از طرح های پژوهشی و اعلام به شورای علمی جهت تصویب نهایی و تسویه حساب با مدیر طرح
- مطالعه و بررسی آیین نامه ها و دستور العمل ها و برنامه های علمی و پژوهشی و ارائه پیشنهادهای لازم
- مطالعه و بررسی امور ارائه شده از سوی معاون پژوهشی و ارائه پیشنهادهای لازم
- مطالعه و بررسی و اعلام نظر در رابطه با امور محوله از سوی رئیس فرهنگستان و شورای علمی